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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 医农并茂,龙吟双全 | 2023年拜谱生物技术工程项目内容合集2:蛋白质组&分泌组&转录组齐致力于,网络热点狙击,攀登“Nature”

医农并茂,龙吟双全 | 2024年拜谱生物项目文章合集:蛋白组&代谢组&转录组齐发力,热点狙击,登顶“Nature”

发布时间:2024-12-06
初冬暖意,叶落铺金。时来达标了2021年的序幕,拜谱怪物在几组学研发的方向拿得了差异性挑战,但其中核蛋白组学、呈现组学、细胞代谢组学、转录组学等厂品促动好几篇好成绩优秀文章发过在全球着名刊物,如Nature、Signal Transduction and Targeted Therapy、Molecular Cancer、Neuron、Advanced Science、Nature Communication等,归属于了中医学、农学等俩个课程的方向。这段话版主精选集一部分好几篇组学研发案例库展现出,促动许多科研课题办公者一定感触。 文章标题寄语 临床医学篇 1.Nature|A brain-to-gut signal controls intestinal fat absorption.(LC-MS/MS) 2.STTT|Genetically programmable cell membrane-camouflaged nanoparticles for targeted combination therapy of colorectal cancer(能源消化吸收) 3.Mol Cancer|A positive feedback loop between PFKP and c-Myc drives head and neck squamous cell carcinoma progression(蛋白质互作组) 4.ACS NANO|Exosome Heterogeneity Affects the Distal “Barrier-Crossing” Trafficking of Exosome Encapsulated Quantum Dots(4D label free蛋白质组) 5.Neuron|Meningeal neutrophil immune signaling influences behavioral adaptation following threat(RNA-seq) 6.Adv Sci| Reconstructing the Stem Leydig Cell Niche via the Testicular Extracellular Matrix for the Treatment of Testicular Leydig Cell Dysfunction(乙酰化血清遮盖组学&非靶消化吸收) 7.Microbiome| Gut microbiota dysbiosis in hyperuricaemia promotes renal injury through the activation of NLRP3 inflammasome(医学研究全靶代谢转化MT1000) 8.Redox Biol|Branched-chain amino acids alleviate NAFLD via inhibiting de novo lipogenesis and activating fatty acid β-oxidation in laying hens(淀粉酶组学&泛素化淀粉酶修饰语组学) 9. Cell. Mol. Life Sci|SIRT1 maintains bone homeostasis by regulating osteoblast glycolysis through GOT1(乙酰化淀粉酶表达组学&养分分泌) 农学篇 10.Adv Sci|VIK-mediated Auxin Signaling Regulates Lateral Root Development in Arabidopsis(磷过酸血清修饰语组学) 11.PNAS|SlCPK27 cross-links SlHY5 and SlPIF4 in brassinosteroid-dependent photo- and thermo-morphogenesis in tomato(RNA-seq) 12.Bioresour Technol|Enhanced biomass production and harvesting efficiency of Chlamydomonas reinhardtii under high-ammonium conditions by powdered oyster shell(非靶产生) 13.Antioxidants (Basel)|Metabolomics Combined with Physiology and Transcriptomics Reveal the Response of Samsoniella hepiali to Key Metabolic Pathways and Its Degradation Mechanism during Subculture(RNA-seq&非靶细胞代谢) 14.J. Agric. Food Chem|A novel dry-cured ham broth-derived peptide JHBp2 effectively inhibits Salmonella typhimurium in vitro : Integrated metabolomic, proteomic and molecular simulation analyses(非靶代谢转化&蛋白质组学)

中医药学领域行业工作亮点

装修案例1

脑到肠内的的信号控制肠内皮下脂肪的吸取

(国当然无线热点关键点词阅读课:中药茶活性酶部分/天然的化学物质;代谢率重程序编程;)

刊物:Nature (IF: 50.5;Q1) 2024 Sep

【拜谱菌物提供了系统:核蛋白组学·LC-MS/MS(小鼠脑干企业样品)】

优秀文章百度百科:上海交通大学医学院附属瑞金医院王卫庆教授团队,在“Nature”上发表了题为“A brain-to-gut signal controls intestinal fat absorption”的文章。文中作者为了深入揭示大脑迷走神经背侧核(DMV)神经元如何抑制肠道脂肪吸收的分子机制,研究团队采用了以天然化合物葛根素为诱饵的活性蛋白质组学策略。通过精心设计的光反应性标签,合成了葛根素特异性探针,并利用这些探针通过光亲和化学反应成功富集和可视化潜在的靶蛋白。经过光亲和反应后,利用高效液相色谱和结合质谱(LC-MS /MS)水平对这些靶蛋白进行了精确鉴定,并从中筛选出GABAA受体α1亚基(GABRA1)作为葛根素的关键作用靶标。为了进一步验证葛根素与GABRA1蛋白之间的相互作用,进行了WB实验,并成功确认了两者之间的联系。此外,利用冷冻电镜(cryo-EM)技术解析了GABAA受体与葛根素的复合物结构,并明确了葛根素结合的具体位置和作用方式。这些发现表明,葛根素作为一种天然化合物,通过靶向GABAA受体α1亚基,能够抑制DMV神经元活性,进而减少肠道脂肪的吸收,为葛根素在肥胖和代谢性疾病治疗中的应用提供了科学依据。

Doi: 10.1038/s41586-024-07929-5B1

拜谱阅读课环节:Nature & Science:球脂肪酸组学帮助中药才朝圣之旅

例2

染色体可程序设计细胞系膜追踪定位纳米技术顆粒广泛用于肠道癌靶点协力冶疗

(国自然而然焦点至关重要词阅读笔记:分解代谢重和程序编写;基因组和程序编写;天然免疫国家宏观调控;巨噬受损细胞;)

刊物:STTT (IF: 40.8; Q1) 2024 Jun

【拜谱海洋生物打造技能:产生组学·消耗的能量产生(小鼠皮内组织开展&贴壁培養生殖细胞)】

稿件简价:四川大学附属华西医院钱志勇教授团队,在“Signal Transduction and Targeted Therapy”上发表了题为“Genetically programmable cell membrane-camouflaged nanoparticles for targeted combination therapy of colorectal cancer”的文章。文中作者介绍MPB-3BP@CM NPs细胞膜仿生纳米药物平台,含有微孔普鲁士蓝纳米颗粒(MPB NPs),作为3-溴丙酮酸(3BP)的光热敏剂和载体,将这些纳米颗粒包裹在一个基因可编程的细胞膜中,可延长在血液中循环时间,特异性识别和靶向癌细胞。体内外实验表明,其能够增强巨噬细胞对CRC细胞的吞噬作用的免疫调节。通过电量新陈代谢必然按量的方式检测到肿瘤细胞糖酵解过程的代谢抑制,并且可以通过光热疗法(PTT)进一步提高治疗效果。

Doi:10.1038/s41392-024-01859-4B1

拜谱讲读联接:STTT(IF=39.3)|重庆上大学钱志勇拜谱生物开发新兴微米颗料适用于结肠道癌的靶向的治疗连合的治疗

典例3

PFKP 和 c-Myc 相互之间的正反两面馈漏电开关驱程头下颚鳞状体细胞癌现况

(国清新热门话题关键性词寄语:产生重程序设计;良性肿瘤微氛围;动脉血管转化;)

期刊杂志:Mol Cancer((IF: 27.7; Q1) 2024 Jul

【拜谱生物体供应技術:球血清组学·球血清互作组(细胞系)】

文章内容详细介绍:安徽医科大学及其附属第一医院刘业海、查晓军教授团队,在“Molecular Cancer”上发表了题为“A positive feedback loop between PFKP and c-Myc drives head and neck squamous cell carcinoma progression”的文章。文中作者聚焦于头颈部鳞状细胞癌(HNSCC),研究表明磷酸果糖激酶-血小板(PFKP)增加了ERK介导的c-Myc的稳定性,而c-Myc在转录水平上刺激PFKP的表达,PFKP的升高促进了HNSCC细胞的增殖、血管生成和转移,通过蛋清互作组查重、IF测定、CoIP 测定证明PFKP可能在HNSCC的进展过程中与ERK2相互作用,这些过程是癌症进展的关键步骤。这项研究揭示了PFKP/c-Myc正反馈回路在HNSCC进展中的关键作用,联合靶向PFKP和c-Myc在HNSCC中将触发协同抗肿瘤效应。

Doi:10.1186/s12943-024-02051-6B1

拜谱阅读课链接转换:工程项目好文章(Molecular Cancer IF=27.7)|PFKP和c-Myc彼此的双面馈径路推动头颈脖鳞状癌细胞癌的现况

实例4

外泌体异质性损害外泌体包囊量子点的远端 "越障 "转迁

(国天然网络热点重要的词选读:外泌体(人体体细胞外囊泡);血脑深层;巨噬人体体细胞;免疫抗体国家宏观调控;)

论文期刊:ACS Nano (IF: 15.88; Q1). 2024 Mar

【拜谱生物体展示 技木:球蛋白质组学·4D label free球蛋白质组(外泌体原材料)】

文章简介:遵义医科大学宋杨教授团队,在“ACS NANO”上发表题为“Exosome Heterogeneity Affects the Distal “Barrier-Crossing” Trafficking of Exosome Encapsulated Quantum Dots”文章。文中作者使用ZnCdSe@ZnS量子点 (QDs)作为纳米颗粒NPs的代表,外泌体在细胞间通讯和生物屏障运输中关键作用,协助纳米颗粒跨越远端屏障,如血脑屏障而进入小鼠大脑。通过4D label free血清组检侧不同来源外泌体蛋白组成和功能异质性,来源于肿瘤细胞的外泌体与来源于巨噬细胞的外泌体比较而言,更能有效促进量子点的远端运输。这项研究表明了外泌体作为外源性NPs跨远端屏障转运的载体的可能性,并为NPs的生物医学应用和风险评估提供了新的信息。

Doi: 10.1021/acsnano.3c0937

案例分享5

脑膜弱酸性粒组织细胞免疫性表现作用攻击后的做法习惯

(国天然共享wifi重中之重词寄语:脑神经免役学;弱酸性粒上皮细胞;市场经济情况;)

期刊论文:Neuron (IF: 17.17; Q1).2024 Nov

【拜谱生物体可以提供系统:转录组学·RNA-seq(小鼠脑公司样品英文)】

文章标题简单介绍:重庆医科大学附属儿童医院董志芳团队联合重庆医科大学基础医学院任春光团队在“Neuron”期刊上发表了题为“Meningeal neutrophil immune signaling influences behavioral adaptation following threat”的研究论文,文中作者首先将雄性和雌性小鼠分别暴露于唤起强烈负面情绪的社会情境(同种小鼠)或非社会情境(玩具、声音)中。利用基因敲除小鼠、RNA-seq测序、神经免疫互作研究方法(抗体/细胞因子治疗、骨髓嵌合、颅骨移植),同时结合经典神经生物学等技术(全细胞膜片钳电生理记录、在体钙信号记录、化学遗传学)揭示了中性粒细胞在神经系统中的扩展功能。中性粒细胞可介导定位于脑膜-大脑界面的神经免疫回路,从而负责感知社会威胁并整合机体内部状态。通过组织脑膜内的免疫信号级联和细胞因子释放,以“无线”的方式联结皮层神经元并负向调节神经反应和防御行为。这项研究揭示了脑膜中性粒细胞信号在此类疾病中的重要功能以及如何参与神经调节机制。

Doi:10.1016/j.2024.10.018

案例库6

睾丸脱体细胞核外产品水凝露合作睾丸间质干体细胞核中药治疗睾酮较弱综上症

(国肯定网络热点的标题阅读笔记:肿瘤生殖细胞外机质;干肿瘤生殖细胞医治;免疫力微的环境;)

期刊论文:Adv Sci (IF: 15.66; Q1).2024 Sep

【拜谱生物体保证新技术:转录组学·RNA-seq&蛋清组·LC-MS/MS(小鼠细胞膜和组织性)】

一篇文章简单介绍:华南理工大学施雪涛教授团队在期刊“Advance Science”发表“ Reconstructing the Stem Leydig Cell Niche via the Testicular Extracellular Matrix for the Treatment of Testicular Leydig Cell Dysfunction ”的文章。文中作者使用一种可塑性、温敏性和可注射性的睾丸脱细胞外基质水凝胶 (TdEC),联合睾丸间质干细胞 (SLC) ,开发了TdECM-SLC的组织工程治疗体系,治疗睾酮缺乏综合征。通过原位注射TdECM-SLC,显著提升了睾酮缺乏症个体的血清睾酮水平,流式细胞术、免疫荧光、RNA-seq、LC-MS/MS等实验结果表明。TdECM在睾丸间质内重塑移植SLC生态位, 促进其增殖和分化,改善衰老睾丸的免疫微环境,为临床的睾酮缺乏症的治疗提供了一种前瞻性的方案。

Doi: 10.1002/advs.202402442

真实案例7

高尿酸偏高血症中直肠菌群失衡能够刺激NLRP3慢性炎症小体推进肾问题

(国自然是焦点关键性词讲读:支原体感染小体;棉纤维化;肠腔菌群;产生重代码编程;)

刊物:Microbiome (IF: 14.65; Q1).2024 Jun

【拜谱怪物提高的技术:细胞分解代谢组学·医学检验全靶细胞分解代谢组学MT1000(大鼠肾脏组织结构)】。

原创文章简洁:南方医科大学赵晓山团队在“Microbiome”志上发表题为“Gut microbiota dysbiosis in hyperuricaemia promotes renal injury through the activation of NLRP3 inflammasome”文章。文中表明HUA诱导肠道菌群失调会促进肾脏损伤的发展,作者使用中医学全靶分泌组学MT1000分析大鼠肾脏代谢组学特征,其机制可能是通过促进肠道尿毒症毒素的产生,进而激活 NLRP3 炎症小体来实现的。了解这一机制对于预防和治疗与高尿酸血症相关的肾脏疾病具有重要意义。通过针对肠道菌群和 NLRP3 炎症小体,可以找到一种治疗肾脏疾病的潜在治疗策略。

Doi: 10.1186/s40168-024-01826-9B1

拜谱阅读课下载链接:Microbiome(IF=13.8)|两组学技术性阐述高血尿酸血症激发的肠管菌群絮乱在肾挫伤中的功效和隐藏逻辑

事例8

支链核苷酸实现减弱蛋鸡大一新生碳水化合物含量出现和促活碳水化合物含量酸β-氧化物来得到缓解NAFLD

(国自燃焦点至关重要词阅读推荐:泛素化;自噬;脂分解;)

刊物:Redox Biol (IF: 11.8; Q1).2024 Nov

【拜谱生物方法带来方法:蛋清组学&泛素化蛋清装饰组学(鸡肝胀)】。

本文简单:浙江大学邹晓庭教授团队在期刊“Redox Biology”上,发表题为“Branched-chain amino acids alleviate NAFLD via inhibiting de novo lipogenesis and activating fatty acid β-oxidation in laying hens”的文章。文中作者展示了饮食中补充67%高支链氨基酸对产蛋鸡NAFLD有独特的缓解影响。蛋白质免疫印迹、免疫荧光、靶向/非靶代谢、泛素化蛋白质淡化组学阐述结果表明,高支链氨基酸强烈激活泛素-蛋白酶自噬,通过下调UFMylation来触发MAPK9介导的DNL、脂肪酸延伸和脂滴形成相关蛋白的泛素化降解,激活PPAR-RXR和脂滴自噬介导的脂肪酸β-氧化和脂肪分解。通过抑制AHR/MAPK9来适度摄入高支链氨基酸,这是NAFLD(非酒精性脂肪肝病)和FLHS(脂肪肝出血综合症)治疗中一个有前景的新策略。

Doi: 10.1016/j.redox.2024.103385

例案9

SIRT1采用GOT1转换成骨癌细胞糖酵解来确保骨稳定

(国那自然热门重要性词选读:糖酵解;转录调节管控;基础代谢重程序编写;)

中文核心期刊:Cell Mol Life Sci (IF: 9.26; Q1). 2024 May

【拜谱生物工程作为技术设备:体现蛋白酶质组学·乙酰化蛋白酶质体现组学&分解组学·消耗的能量分解(小鼠全身肌肉骨组织性/小鼠颅骨)】

优秀文章百度百科:西安交通大学孙宏志教授团队在期刊“Cellular and Molecular Life Sciences”发表“SIRT1 maintains bone homeostasis by regulating osteoblast glycolysis through GOT1”的文章。文中作者发现成骨细胞特异性SIRT1条件敲除(cKO)小鼠模型,表现出较低的骨小梁和皮质骨量伴随着较低的骨形成和骨吸收。综合非靶消化吸收-热量消化吸收和乙酰化血清修饰语组学分析以及免疫沉淀、基因敲除和位点突变实验表明,SIRT1缺失通过直接结合并增加谷氨酰胺草酰乙酸转氨酶1(GOT1)的乙酰化水平来抑制糖酵解。SIRT1通过其对GOT1的脱乙酰酶活性在调节成骨细胞代谢以维持骨稳态方面发挥着至关重要的作用,为骨相关疾病治疗提供了新的潜在靶点。

Doi: 10.1007/s00018-023-05043-9

农学研究方向提升

案例分析10

蛋白酶激酶VIK介导发展素数据信息自我调节拟南芥侧根健康发育的团伙机理

(国肯定热门关健词阅读推荐:泛素化;磷酸性反应;干細胞;)

论文期刊:Adv Sci (IF: 15.66; Q1).2024 Sep

【拜谱生物体能提供技术工艺:绘制蛋白酶组学·磷碱化绘制组学(拟南芥小苗)】

本文简单:山东大学丁兆军教授团队在期刊“Advanced Science”上发表了题为“VIK-mediated Auxin Signaling Regulates Lateral Root Development in Arabidopsis”的研究论文,文中作者通过生长素处理拟南芥幼苗的侧根筛选到快速响应生长素的蛋白激酶VIK。研究采用磷硝化作用装饰组学、LC-MS/MS质谱数据分析、CO-IP、酵母双杂和荧光素酶互补成像等技术,发现VIK调控侧根发生,进而构建了VIK-LBD18/ERF13蛋白质磷酸化修饰模块,阐明正向调控侧根发育。本研究阐明了VIK介导的生长素信号在侧根形成中的分子机制,以及生长素通过关键激酶调控蛋白磷酸化修饰以实现其信号传递的机制。

Doi:10.1002/advs.202402442

拜谱讲读友链:创业项目好文章Advanced Science( IF=14.3)|磷过酸遮盖组学分享绿植侧根健康成长的要点探索与发现

例11

CPK27合力HY5和PIF4调整冬油菜素内酯介导的番茄光温形状修建

(国必然wifi最为关键的词寄语:磷过酸;转录调空;蛋清激酶;)

期刊杂志:PNAS (IF: 11.21; Q1) 2024 Sep

【拜谱怪物给出高技术:转录组学·RNA-seq(番茄)】。

经典文章介绍:浙江大学周艳虹、喻景权共同通讯在期刊“PNAS”在线发表题为“SlCPK27 cross-links SlHY5 and SlPIF4 in brassinosteroid-dependent photo- and thermo-morphogenesis in tomato”的研究论文。研究发现,激活的番茄HY5(SlHY5)会触发一个钙依赖蛋白激酶SlCPK27的转录。转录组测序结果表明SlCPK27与SlPIF4相互作用,并在Ser-252和Ser-308磷酸化位点上对其进行磷酸化,以促进其降解。SlPIF4主要通过激活油菜素内酯(BR)生物合成中的一个关键基因SlDWF的转录来促进下胚轴的伸长。这种SlHY5-SlCPK27-SlPIF4-BR级联反应不仅在光形态建成中起着至关重要的作用,还调节热形态建成。文中作者揭示“HY5-CPK27-PIF4”模块在光温形态建成中的作用机制通过影响油菜素内酯(Brassinosteroid, BR)合成来响应环境光和温度的变化,从而调控植物生长影响番茄形态建成,阐明了光信号与Ca2+信号在番茄幼苗光温信号响应中的协同作用。

Doi: 10.1073/pnas.2403040121

拜谱前言下载链接:产品优秀文章(PNAS IF=10.8)|SlCPK27介导的光和温度因素无线信号在番茄光温基本特征建设中的监测能力

例案12

粉化牡蛎肉壳在高铵因素下改善莱茵衣藻的生物制品量研发和得到速度

(国清新热点话题首要词选读:微生态学水解酸性反应池剂;培养出基酸性反应;微微生态学群落)

中文核心期刊:Bioresour Technol (IF: 9.64; Q1).2024 Jul

【拜谱微生物供给能力:分解代谢转化组学·非靶分解代谢转化(藻类植物)】

原创文章百度百科:中国海洋大学吴浩浩教授团队在期刊“Bioresource Technology”上发表了题为“Enhanced biomass production and harvesting efficiency of Chlamydomonas reinhardtii under high-ammonium conditions by powdered oyster shell”,文中作者利用粉末状牡蛎壳作为石灰剂、补充碳源和生物絮凝剂,在富含NH4+的环境中提高生物质生产和微藻收获。莱茵衣藻更喜欢铵(NH4+)作为氮源,但由于介质酸化,其在高NH4+浓度(0.5~1 g/L)下的后期生长受到阻碍。在本研究中,通过ICP-MS阐述测定微量元素含量、使用Zetasizer Nano ZS仪器测量微藻细胞的ζ电位,结果表明在1L气泡柱生物反应器的TAP培养基中,牡蛎壳粉可以提高C.reinhardtii对0.7 g/L NH4+补充的耐受性,从而使生物量增加22.9%,不饱和脂肪酸积累增加62.1%,收获效率提高19.2%。粉末牡蛎架缓解了培养基酸化(pH 7.2–7.8),并提供了高达8.02×103μmol/L的溶解无机碳,促进了76.3%的NH4+消耗,高达189 mg/L的Ca2+释放,ζ电位降低42.1%,微藻细胞的絮凝活性提高27.7%。本研究强调了一种很有前途的方法,即利用粉末状牡蛎壳作为石灰剂、补充碳源和生物絮凝剂,在富含NH4+的环境中提高生物质生产和微藻收获。

Doi: 10.1016/j.biortech.2024.130904

例案13

产生组学紧密结合生物学学和转录组学阐述了黑皮氏参菌在亚培养计划过程中中对首要产生条件的反应以至于溶解共识机制

(国自然而然热点话题重点词阅读推荐:糖分解;染色体自我调节;分解重程序编程;)

中文核心期刊:Antioxidants (Basel) (IF: 5.3; Q1). 2024 Jun

【拜谱生物工程给予的技术:转录组学·RNA-seq&细胞分解组学·非靶细胞分解多个学蝙蝠蛾拟青细菌(丝状白色念珠菌)】。

句子简单介绍:扬州大学刘瑞教授团队,在期刊“Food Chemistry”上发表文章“Metabolomics Combined with Physiology and Transcriptomics Reveal the Response of Samsoniella hepiali to Key Metabolic Pathways and Its Degradation Mechanism during Subculture”。在丝状真菌的次培养过程中,会出现明显的降解迹象,这会影响菌株的生长和发育,改变代谢物含量,并干扰基因表达,然而丝状真菌降解的具体分子机制尚不清楚。本研究以一种丝状真菌Samsoniella hepiali为研究对象,并持续进行传代培养。结果表明,当菌株传代培养到到了F8代,菌株开始出现降解的迹象,表现为影响改变表观形态,降低生长速度和产孢量,破坏抗氧化剂系统。进一步进行转录组学和产生组学分析,结果显示差异表达基因(DEGs)和差异积累代谢物(DAMs)主要富集于四种代谢途径:ABC转运体;脂肪酸降解;丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢以及嘌呤代谢等许多在不同途径中显著富集的代谢物可能主要由蛋白质和酶的基因调节,例如Abcd3、Ass1和Pgm1。而在传代过程中,许多可诱导细胞凋亡和衰老的基因和代谢物不断积累,导致细胞受损并消耗大量能量,最终导致菌丝的抑制增长。综上所述,文中作者转录组学和代谢组学分析丝状真菌降解机制,发现蛋白质和酶的基因调控可能影响代谢物积累,而细胞凋亡和衰老相关基因和代谢物的积累导致细胞损伤和能量消耗,最终抑制菌丝生长。研究结果揭示了菌株降解的可能原因和关键代谢途径的响应。

Doi: 10.3390/antiox13070780

经典案例14

那种新的干腌火腿汤延伸肽—JHBp2在身体外高效治理和改善鼠伤寒沙门氏菌:融合产生组学、高蛋白质组学和大分子养成阐述

(国清新网络热点核心词经典导读:糖酵解;糖分解代谢;出核入核管理机制;)

学术期刊:J. Agric. Food Chem (IF: 5.28; Q1). 2024 Jun

【拜谱生物体具备技艺:非靶分泌&血清组学(沙门氏菌)】

软文详细资料:南京农业大学张万刚教授在期刊“Journal of Agricultural and Food Chemistry”上发表了题为“A novel dry-cured ham broth-derived peptide JHBp2 effectively inhibits Salmonella typhimurium in vitro : Integrated metabolomic, proteomic and molecular simulation analyses”的文章。JHBp2是从金华火腿汤中纯化的一种肽,对鼠伤寒沙门氏菌具有抗菌活性。使用非靶向代谢组学和无标记定量蛋白质组学分析JHBp2处理后鼠伤寒沙门氏菌的代谢和蛋白质表达变化。细胞壁和膜损伤结果表明JHBp2具有破坏膜的特性,导致细胞内核酸和蛋白质的泄漏。基础代谢组学揭示516种差异表达代谢产物,涉及辅因子生物合成、嘌呤代谢、ABC转运蛋白、谷胱甘肽代谢、嘧啶代谢等。球营养素组学检测735种差异表达蛋白,涉及丙酮酸代谢、氨基酸生物合成、嘌呤代谢、碳代谢、糖酵解/糖异生等。RT-qPCR和蛋白质组学结果显示正相关,分子对接显示JHBp2与一些差异表达蛋白稳定结合。总之,JHBp2可以破坏鼠伤寒沙门氏菌的细胞壁和膜结构,干扰膜相关蛋白的合成,引发细胞内物质泄漏,并降低参与能量代谢、氨基酸合成代谢和核苷酸合成代谢的酶和代谢产物的水平。

Doi: 10.1021/acs.jafc.4c01531

拜谱阅读笔记超链接:新项目稿件(J. Agric. Food Chem.)|与探讨S-亚硝基化对Caspase-3淡化和肌棉纤维血清生物降解的干扰

拜谱个人总结

2024年,拜谱生物与合作伙伴共同书写了科研服务的新篇章。研究成果覆盖医学和农学两大领域,涉及多种物种和样本类型,展现了公司在多组学技术领域的深厚实力和广泛应用前景。拜谱生物依托强大的技术平台,利用质谱技术、蛋白质组、代谢组、基因组、大数据、医学、农学、药学等多学科和生命科学的交叉融合、技术创新,为客户提供从样本量补救到数据表格分析一下的站台式功能。我们的拜谱生物确保了数据的准确性和可靠性,助力科研成果的快速转化。我们期待在未来的日子里,继续为客户提供高质量的服务,推动科学发现,助力科学家深入探索生命科学的奥秘,造福人类健康。

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